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ImageJ实用技巧之免疫组化与特殊染色

文章来源:文章来源 抓取时间:2019-02-17 22:08:21 浏览量:122 作者:微笑如酒 返回文章列表


众所周知,对于科研狗来说,实验并不是拍出那么几张靓丽图片就能万事大吉,不拿出对应的统计图来说明问题,定会被老板骂的体无完肤。今天为大家带来小弟平时分析数据用的最多最常用,堪称神器的软件ImageJ。


这是一张肝脏的天狼猩红染色图,其中红色代表的是I与III型胶原阳性染色,统计这张图中红色部分占整张图片的面积百分比。




1.在电脑上打开这个神器ImageJ,会出现如图显示的工具栏




2. 将需要统计的图片在imageJ中打开




3.在图3显示的工具栏中选择image按钮,然后选择Type,再选择RGBStack按钮。




4.此时再将图片下方的调节滑轮拉到中间或是最右边,以获得最佳的对比度。





5.再选择image按钮,然后点击Adjust,再Threshold按钮




6.出现threshold窗口




7.此时只需调节上下两个滑轮即可对图片阳性染色面积进行标记(一般免疫组化或特殊染色只需调节下面这个滑轮,免疫荧光则相反)




8.此时的红色部分就是你的阳性染色部分,然后进入统计阶段,先点击Analyze按钮,然后Set Measurements按钮,出现弹窗后再点击Area fraction按钮(一般这一步第一次设置后,以后都不用设置了)




9.计算出阳性染色面积的百分比,点击Analyze按钮,然后点measure按钮即可, 图中6.164即为阳性染色面积百分比




.....华丽丽的分隔线.....


这是一张免疫荧光图,我需要统计其中红色部分的阳性染色面积




说完了免疫组化与特殊染色的部分,其实免疫荧光的统计和上面一样,只是在threshold这一步有点差别


1.1---6步骤都是一样,按照处理变成了下图




2.按图下方的滑轮保持在左边不变,然后在threshold窗口将下方滑轮滑到最右边,上方滑轮左右调节






3.计算出阳性染色面积的百分比,点击Analyze按钮,然后点measure按钮即可




总结:今天主要是给大家演示了imageJ最常用的两个功能,不过这种统计也有局限性,如果碰见Ki67这种需要计算增殖细胞个数的免疫组化,则推荐大家用IPP进行统计。


.....华丽丽的分隔线.....


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